In der Neukonfiguration des Helmholtz-Instituts für Biomedizinische Technik als fakultätsübergreifendes Institut der Rheinisch-Westfälischen Technischen Hochschule (RWTH) Aachen mit insgesamt sieben Professuren verfolgt das Institut für Angewandte Medizintechnik der Medizinischen Fakultät ein zukunftsorientiertes Biomedizinische Technik-Profil, das sich durch die Verbindung der Medizintechnik mit den Biowissenschaften auszeichnet. Die RWTH bietet hierfür mit ihren technischen Fakultäten, der naturwissenschaftlichen Fakultät und dem unmittelbar benachbarten Universitätsklinikum mit der Medizinischen Fakultät hervorragende Voraussetzungen.

Das Institut arbeitet mit den anderen Professuren des Helmholtz-Instituts und vielen weiteren technischen und naturwissenschaftlichen Instituten der RWTH zusammen. Hieraus resultieren zahlreiche gemeinsame Forschungsvorhaben und gemeinsam betreute ingenieurwissenschaftliche, naturwissenschaftliche und medizinische Dissertationen. Im Rahmen von Kooperationen mit industriellen Partnern stehen neben Forschungs- und Entwicklungsarbeiten die experimentelle Validierung bis hin zur technisch begleiteten Betreuung innovativer Verfahren in der Klinik im Vordergrund.

Die Arbeitsgruppe „Cardiovascular Engineering“, 1971 durch Professor Helmut Reul gegründete und seit 2005 von Dr.-Ing. Ulrich Steinseifer geleitet, führt mit der stark maschinenbaulich-ingenieurwissenschaftlich geprägten Entwicklung von Unterstützungssystemen für Herz und Lunge traditionelle Aachener Stärken fort.

In enger Interaktion dazu stehen die biomedizinischen Forschungsaktivitäten durch die seit 2005 in das Institut integrierte  Arbeitsgruppe „Cardiovascular Tissue Engineering“, geleitet von Dr. med. Stefan Jockenhövel.

Das Lehr- und Forschungsgebiet Rehabilitations- und Präventionstechnik wird von Frau Univ.-Prof'in Dr. rer. nat. Catherine Dißelhorst-Klug geleitet und widmet sich der Biosignalerfassung und –verarbeitung mit speziellem Fokus auf die  Biomechanik der Bewegung. Hierbei steht die Entwicklung und der Einsatz technischer Systeme in der Rehabilitation und Prävention im Vordergrund.

Erweitert wird dieses Spektrum durch die Arbeitsgruppe „Nanomedizin“, geleitet von Priv.-Doz. Dr. rer. nat. Martin Baumann, und die Allianz mit dem Lehr- und Forschungsgebiet „Experimentelle Medizin und Immuntherapie“ von Univ.-Prof. Dr. Dr. Stefan Barth. Hiermit wird auch personell eine Brücke zum Aachener Fraunhofer-Institut für Molekulare Biotechnologie geschlagen.

Besonderes Merkmal des Instituts für Angewandte Medizintechnik ist die direkte Kooperation mit den klinischen Partnern, die durch die unmittelbare Nachbarschaft des Helmholtz-Instituts zum Universitätsklinikum der RWTH gefördert wird. So bestehen enge Kooperationsbeziehungen und personelle Verbindungen durch gemeinsame Mitarbeiter zur Klinik für Radiologische Diagnostik (Leiter der gemeinsamen Arbeitsgruppe: Priv.-Doz. Dr. med. Andreas Mahnken) und zur Chirurgischen Klinik (Leiter der gemeinsamen Arbeitsgruppe: Prof. Dr. med. Uwe Klinge). Das Institut für Angewandte Medizintechnik verfügt auch über Forschungsflächen im Gebäude des Universitätsklinikums.